پژوهش‌سرای امام رضا(ع) در کنار فعالیت‌های محتوایی به موضوع زیرساختی و توسعه فضاهای آموزشی نیز توجه دارد. به عنوان نمونه آکادمی بهبود تندرستی و سلامتی در نیمه دوم سال تحصیلی ۱۴۰۱ در بخشی از فضاهای فیزیکی پژوهش‌سرای امام رضا(ع) افتتاح شد. دانش‌آموزان در مرحله اول، از نظر جسمی و حرکتی توسط کارشناسان مورد بررسی و ارزیابی و سپس با تمرین‌های استاندارد ویژه هر فرد تحت اصلاح و درمان قرار می‌گیرند. آکادمی تندرستی برای نخستین بار در کشور به دانش‌آموزان «کارنامه تندرستی» ارائه می‌کند که شامل ۲۰ صفحه ارزیابی‌های تخصصی ساختار قامتی، حرکتی، عملکردی، تست عضلانی، ترکیب بدنی و نیز استعدادیابی است که به زبان ساده، به خانواده دانش‌آموز اطلاعاتی در خصوص تندرستی و یا هر سطح از ناهنجاری جسمانی می‌دهد تا در اسرع وقت با شرکت در دوره‌های اصلاحی و درمانی این مجموعه، اقدام به پیشگیری از سطح جدی‌تری از اختلالات نماید.

تجربه عملی آموخته‌ها
همچنین «سرزمین دانایی» با هدف آموزش عملی محتوای کتاب‌های درسی، تعمیق آموخته‌ها و متنوع‌سازی محیط‌های آموزشی به منظور درک ساده‌تر مفاهیم علمی از مسیر سرگرمی‌های علمی، در پژوهش‌سرا شکل گرفت. دانش‌آموزان مدارس امام رضا(ع) در قالب اردوهای علمی و بازدید از این مجموعه جدید، می‌توانند با مفاهیمی نظیر فضا و زمان، نیرو، انرژی، گرانش، نور و ماهیت اجسام، قوانین فیزیک و مفاهیم نجوم به صورت عملی آشنا شوند.

بازدیدهای علمی و کارگاه‌های تخصصی
همچنین به منظور دیدن تجربه از نزدیک فرایند کاشت، داشت و برداشت گیاهان دارویی و زینتی توسط دانش‌آموزان، گلخانه آموزشی در این پژوهش‌سرا احداث شد. دانش‌آموزان در قالب بازدیدهای علمی از این گلخانه، با مراحل و ملزومات کاشت، نگهداری و پرورش گیاهان و برداشت محصول از جمله کاشت هیدروپونیک، کشاورزی عمودی، انواع ابزارآلات گلخانه‌ای، سیستم آبیاری گلخانه‌ای، انواع خاک و کود آشنا می‌شوند. به منظور انتقال بهتر مفاهیم آموزشی به دانش‌آموزان، بازدیدهای علمی و کارگاه‌های تخصصی، پارک گیاهان دارویی راه‌اندازی شد. در بازدیدهای مدارس، دانش‌آموزان پس از برداشت گیاهان دارویی در شش گونه؛ اسطوخودوس، مریم‌گلی، همیشه‌بهار، نعنا، رزماری و آویشن و سپس عصاره‌گیری در آزمایشگاه این مجموعه، نحوه خشک کردن و استخراج عصاره گیاهان دارویی را تجربه می‌کنند.